| 管材质量不理想： |
管道分质供水管材目前主要是PE、PVC、PPR材料制作，还有不锈钢。据中国科学院广州地球化学研究所的一项研究，目前，国产塑料管因质量不过关，在经深度处理的水中会溶出一些物质影响水的口感与质量，而进口料塑料管价格较高，开发商一般都不采用。使用不锈钢材料的工程就更少了。
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| 系统没有针对性： |
目前管道分质供水制水系统有进口与国产产品，一般采用RO膜为处理核心。RO膜处理自来水具有一些优点，同时也有缺点，优点是去污率高。缺点是成本较高，水回收率低，处理出的水基本上属纯水范畴，PH值呈酸性。同时分质供水公司普遍采用RO膜，还与国家分质供水标准不规范有关。因国家尚无统一标准有些地方用瓶装饮用纯净水标准来评价管道分质供水，给企业带来不必要的困难。 |
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| 管网设计还存在问题： |
分质供水系统为循环管路，但循环管路的设计没有规范，各家的设计存在差异，有些水路循环不一定布置得很好，甚至发现有死水的情况。 |
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| 杀菌技术： |
杀菌技术是分质供水的关键。如何保持保持水在管网中不孳生细菌，氯杀菌是目前国际上不能替代的技术。然而，目前有些小区，采用OV或O3杀菌，从理论上与实际上是不能保持水的细菌学指标的。据调查，目前采用O3杀菌，细菌学指标均会存在问题，O3具有强氧化作用，对管材等均有强氧化作用如水中维持有0.05ppmO3，消毒副产物含量多，而且在很大程度上影响水的口感。目前，真正做到细菌达标的公司不太多。 |
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| 自动控制技术： |
管道直饮水应做到生产、供水、杀菌、循环的自动控制。从目前调查看，不少公司在设计上未采用自动，而是手动控制，系统投入使用后操作、维护工程量过大，非专业用户难以掌控。 |
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